金线莲的品种众多，选择哪种较好取决于多个因素。福建金线莲是金线莲中的优质品种，其药用价值较高，叶片狭长，叶脉金黄色，十分美丽。福建尖叶金线莲在药用价值方面也表现出色。此外，福建小叶种的金线莲也颇受青睐，叶子呈红褐色，有银白色的叶脉。
台湾金线莲的叶子呈桃心形，叶面鲜绿色，嵌有银白色网脉。云南金线莲的叶子较为细长，叶脉颜色较浅，药用价值与其他品种相似但成分略有不同。云南金线莲的叶片更为宽大，叶脉颜色更深，价格相对较低。
在选择金线莲时，可参考以下几点：一是观察叶脉，金线越密越繁复的越好；二是查看茶汤颜色，不管是干品还是鲜品，泡水或煮开后茶汤颜色越深越好，且闻起来有甘薯的味道，味道越浓郁说明有效成分含量越高；三是从价格判断，价格过低的效果较差、质量欠佳。同时，还需注意辨别金线莲的真伪优劣，可依据“金（银）网脉、紫背叶，草茎细长有鞘节，清香气浓识金草”的歌诀进行判断。另外，叫雨山仿野生金线莲也是不错的选择，其生长在原始森林中，品质上乘，具有较高的营养价值和药用功效。总之，选择金线莲应综合考虑品种特点、外观特征、有效成分含量等因素。